L’organisation de l’AMSTES est articulée autour de son assemblée générale. Elle est dirigée par un bureau exécutif élu. Le bureau exécutif est composé de sept membres: un Président, un Vice-Président, un Secrétaire Général, un Vice-Secrétaire Général, un Trésorier, et deux Conseiller. Il trace les orientations, gère l’organisation des activités, et veille à l’application des principes et du règlement de l’association.